Ранее сообщалось о случаях коинфекции двумя вариантами. Не так много было известно о вирусной рекомбинации, дающей вирусы с гибридными геномами. Два недавних исследования сообщают о случаях генетической рекомбинации среди вариантов SARS-CoV-2 Denta и Omicron. Рекомбинант, названный Дельтамикрон, имел черты обоих вариантов.
Термин «дельтакрон» появился в начале этого года¹ для обозначения случаев коинфекции COVID-19 у людей, инфицированных различными вариантами вируса SARS-CoV-2, например, дельта- и омикрон. Дельмикрон или дельтакрон обозначали инфекцию, вызванную комбинацией «двух вариантов одного и того же штамма вируса, SARS-CoV-2», и не назывались разными « штаммами ».
Однако недавно были зарегистрированы случаи генетической рекомбинации между двумя различными штаммами SARS-CoV-2 . 8 марта 2022 года исследователи сообщили о трех случаях заражения на юге Франции рекомбинантным вирусом «Дельтамикрон», геном которого представлял собой гибрид, содержащий шиповидный белок от варианта Омикрон и «тело» варианта Дельта. Гибридный геном имел характерные мутации обеих линий. Рекомбинантный шиповидный белок мог оптимизировать связывание вируса с мембраной клетки-хозяина.
В США (USA 3) также появились доказательства рекомбинации Delta и Omicron . Эта группа смогла идентифицировать два независимых случая рекомбинации Delta-Omicron. В обоих случаях 5'-конец вирусного генома принадлежал геному Delta , а 3'-конец — геному Omicron.
Предполагается, что рекомбинантные вирусы встречаются нечасто, и нет никаких доказательств того, что рекомбинантные вирусы с гибридными геномами более трансмиссивны или вирулентны, чем доминирующие циркулирующие варианты.
Ссылки:
- Дельтакрон не является новым штаммом или вариантом. Научный европеец. Опубликовано 9 января 2022 г. Доступно по адресу http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/deltacron-is-not-a-new-strain-or-variant/
- Колсон, П., и др. 2022. Культура и идентификация «дельтамикрона» SARS-CoV-2 в группе из трех случаев на юге Франции. Препринт medRxiv. Опубликовано 08 марта 2022 г. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.03.03.22271812
- Бользе А., и др. 2022. Доказательства коинфекции и рекомбинации SARS-CoV-2 Delta и Omicron. Препринт medRxiv. Опубликовано 12 марта 2022 г. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.03.09.22272113
