Варианты коронавируса: что мы знаем до сих пор

Коронавирусы — это РНК- вирусы, принадлежащие к семейству Coronaviridae. Эти вирусы демонстрируют чрезвычайно высокую частоту ошибок при репликации из-за отсутствия корректирующей нуклеазной активности их полимераз. У других организмов ошибки репликации исправляются, но коронавирусы этой способности лишены. В результате ошибки репликации у коронавирусов остаются неисправленными и накапливаются, что, в свою очередь, служит источником изменчивости и адаптации этих вирусов . Таким образом, для коронавирусов всегда было характерно подвергаться мутациям в своих геномах с чрезвычайно высокой частотой; чем больше передача, тем больше ошибок репликации происходит и, следовательно, тем больше мутаций в геноме, что приводит к появлению большего количества вариантов.

Очевидно, что превращение в новые варианты не является чем-то новым для коронавирусов . В недавней истории человеческие коронавирусы постоянно мутировали, образуя новые формы. С 1966 года, когда был зафиксирован первый случай, существовало несколько вариантов, ответственных за различные эпидемии.

SARS-CoV был первым смертельно опасным вариантом вируса, вызвавшим эпидемию коронавируса в провинции Гуандун в Китае в 2002 году. MERS-CoV стал следующим важным вариантом, вызвавшим эпидемию в Саудовской Аравии в 2012 году.

Новый коронавирус SARS-CoV-2, вариант, ответственный за нынешнюю пандемию COVID-19, которая началась в декабре 2019 года в Ухане, Китай, и впоследствии распространилась по всему миру, став первой коронавирусной пандемией в истории человечества, постоянно подвергался дальнейшей адаптации, накапливая мутации в различных географических регионах, что привело к появлению нескольких субвариантов . Эти субварианты имеют незначительные различия в своем геноме и белках-шипах, а также демонстрируют различия в скорости передачи, вирулентности и способности ускользать от иммунного ответа.

В зависимости от угрозы, которую представляют эти субварианты, они подразделяются на три категории: варианты, вызывающие опасения (VOC), варианты, представляющие интерес, или варианты, находящиеся на стадии исследования (VOI), и варианты, находящиеся под наблюдением. Группировка субвариантов основана на данных, касающихся трансмиссивности, иммунитета и тяжести инфекции.

1. Варианты, вызывающие озабоченность (VOC) 

Варианты, вызывающие озабоченность (ЛОС), имеют четкую связь с увеличением трансмиссивности или вирулентности или снижением эффективности любых мер общественного здравоохранения, таких как эффективность вакцин, которые используются в настоящее время. 

2. Представляющие интерес или расследуемые варианты (VOI) 

Известно, что представляющие интерес или исследуемые варианты (VOI) имеют генетические изменения, которые могут повлиять на их передачу, вирулентность или эффективность мер общественного здравоохранения, и установлено, что они вызывают значительную передачу инфекции в сообществе.

3. Варианты под контролем  

Контролируемые варианты обнаруживаются как сигналы, и есть признаки того, что они могут иметь свойства, аналогичные ЛОС, но доказательства могут быть слабыми. Следовательно, эти варианты постоянно отслеживаются на предмет любых изменений.  

Эта группировка является динамической, что означает, что подварианты могут быть удалены из одной группы или включены в любую группу в зависимости от изменения в оценке угроз с точки зрения трансмиссивности, иммунитета и серьезности инфекции.  

Как ни парадоксально, эволюция SARS-CoV-2 в настоящее время, похоже, является непрерывным процессом. Исходя из природы этого вируса , пока происходит передача между людьми, будут возникать ошибки репликации и мутации. Некоторые мутанты или варианты могут преодолеть селективное давление, став более заразными и вирулентными, или ускользнуть от иммунного ответа, что снизит эффективность вакцины. Возможно, со временем в регионах с более высокой передачей будет обнаружено гораздо больше вариантов. Минимизация передачи и постоянный мониторинг являются ключом к стратегиям сдерживания.

источники:  

1. Прасад У., 2021. Новые штаммы SARS-CoV-2 ( вирус ответственный за COVID-19): Может ли подход «нейтрализации антител» стать ответом на быструю мутацию? Научный европеец. Опубликовано 23 декабря 2020 г. Доступно на сайте: http://scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/  

2. ВОЗ, 2021. Отслеживание вариантов SARS-CoV-2. Доступно в Интернете по адресу https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

3. ECDPC 2021. Варианты SARS-CoV-2, вызывающие озабоченность, по состоянию на 8 июля 2021 года. Доступно на сайте https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern