Коронавирусы - это РНК-вирусы, принадлежащие к семейству coronaviridae. Эти вирусы демонстрируют чрезвычайно высокий уровень ошибок во время репликации из-за отсутствия проверки нуклеазной активности их полимераз. У других организмов ошибки репликации исправлены, но у коронавирусов нет этой способности. В результате ошибки репликации в коронавирусах остаются неисправленными и накапливаются, что, в свою очередь, служит источником изменчивости и адаптации этих вирусов. Таким образом, коронавирусы всегда подвергались мутации в своих геномах с чрезвычайно высокой скоростью; чем больше передача, тем больше ошибок репликации и, следовательно, больше мутаций в геноме, приводящих, соответственно, к большему количеству вариантов.
Очевидно, что переход на новые варианты для коронавирусов не новость. В новейшей истории человеческие коронавирусы накапливают мутации в новые формы. Было несколько вариантов, ответственных за различные эпидемии с 1966 года, когда был зафиксирован первый эпизод.
SARS-CoV был первым смертельным вариантом, вызвавшим эпидемию коронавируса в провинции Гуандун в Китае в 2002 году. MERS-CoV стал следующим важным вариантом, вызвавшим эпидемию в Саудовской Аравии в 2012 году.
Новый коронавирус SARS-CoV-2, вариант, ответственный за нынешнюю пандемию COVID-19, которая началась в декабре 2019 года в Ухане, Китай и впоследствии распространилась по всему миру, став первой пандемией коронавируса в истории человечества, постоянно подвергается дальнейшей адаптации, накапливающей мутации. в разных географических регионах, что дает начало нескольким подвариантам. Эти подварианты имеют незначительные различия в своем геноме и белках-шипах и показывают различия в скорости передачи, вирулентности и инфекционности иммунного ускользания.
В зависимости от угрозы, которую представляют эти подварианты, они сгруппированы по трем категориям: вызывающие озабоченность варианты (VOC), представляющие интерес или расследуемые варианты (VOI) и варианты, находящиеся под наблюдением. Эта группировка подвариантов основана на доказательствах, связанных с трансмиссивностью, иммунитетом и серьезностью инфекции.
- Варианты, вызывающие озабоченность (VOC)
Варианты, вызывающие озабоченность (ЛОС), имеют четкую связь с увеличением трансмиссивности или вирулентности или снижением эффективности любых мер общественного здравоохранения, таких как эффективность вакцин, которые используются в настоящее время.
| Этикетка ВОЗ | Родословные | Страна впервые обнаружена (сообщество) | Год и месяц первого обнаружения |
| Альфа | В.1.1.7 | Великобритания | Сентябрь 2020 |
| бета | В.1.351 | Южно-Африканская Республика | Сентябрь 2020 |
| Гамма | P.1 | Бразилия | Декабрь 2020 |
| Delta | В.1.617.2 | Индия | Декабрь 2020 |
- Представляющие интерес или расследуемые варианты (VOI)
Известно, что представляющие интерес или исследуемые варианты (VOI) имеют генетические изменения, которые могут повлиять на их передачу, вирулентность или эффективность мер общественного здравоохранения, и установлено, что они вызывают значительную передачу инфекции в сообществе.
| Этикетка ВОЗ | Родословные | Страна впервые обнаружена (сообщество) | Год и месяц первого обнаружения |
| расчетное время прибытия | В.1.525 | Нигерия | Декабрь 2020 |
| йота | В.1.526 | США | Ноябрь 2020 |
| Каппа | В.1.617.1 | Индия | Декабрь 2020 |
| Лямбда | C.37 | Перу | Декабрь 2020 |
- Варианты под контролем
Контролируемые варианты обнаруживаются как сигналы, и есть признаки того, что они могут иметь свойства, аналогичные ЛОС, но доказательства могут быть слабыми. Следовательно, эти варианты постоянно отслеживаются на предмет любых изменений.
| Этикетка ВОЗ | Родословные | Страна впервые обнаружена (сообщество) | Год и месяц первого обнаружения |
| В.1.617.3 | Индия | Февраль 2021 | |
| A.23.1 + E484K | Великобритания | Декабрь 2020 | |
| Лямбда | C.37 | Перу | Декабрь 2020 |
| B.1.351 + P384L | Южно-Африканская Республика | Декабрь 2020 | |
| B.1.1.7 + L452R | Великобритания | Январь 2021г. | |
| B.1.1.7 + S494P | Великобритания | Январь 2021г. | |
| C.36 + L452R | Египет | Декабрь 2020 | |
| AT.1 | Россия | Январь 2021г. | |
| йота | В.1.526 | США | Декабрь 2020 |
| Zeta | P.2 | Бразилия | Январь 2021г. |
| АВ.1 | Великобритания | Март 2021 | |
| P.1 + P681H | Италия | Февраль 2021 | |
| Б.1.671.2 + К417Н | Великобритания | Июнь 2021 |
Эта группировка является динамической, что означает, что подварианты могут быть удалены из одной группы или включены в любую группу в зависимости от изменения в оценке угроз с точки зрения трансмиссивности, иммунитета и серьезности инфекции.
По иронии судьбы, эволюция SAR-CoV-2 в настоящее время, похоже, продолжается. Исходя из природы этого вируса, до тех пор, пока существует передача среди людей, будут возникать ошибки репликации и мутации. Некоторые мутанты или варианты могут преодолеть давление отбора, чтобы стать более заразными и вирулентными, или избежать иммунного ответа, что сделает вакцину менее эффективной. Возможно, со временем будет обнаружено гораздо больше вариантов в регионах с более высокой передачей. Сведение к минимуму передачи и постоянный мониторинг являются ключом к стратегиям сдерживания.
источники:
- Прасад У., 2021. Новые штаммы SARS-CoV-2 (вирус, ответственный за COVID-19): может ли подход «нейтрализующих антител» стать ответом на быструю мутацию? Научный европеец. Опубликовано 23 декабря 2020 г. Доступно онлайн по адресу https://www.scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/
- ВОЗ, 2021. Отслеживание вариантов SARS-CoV-2. Доступно в Интернете по адресу https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- ECDPC 2021. Варианты SARS-CoV-2, вызывающие озабоченность, по состоянию на 8 июля 2021 года. Доступно на сайте https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
