Какапо Попугай: преимущества геномного секвенирования Программа сохранения

Попугай Какапо (также известный как «сова») попугай(из-за черт лица, напоминающих сову) — находящийся под угрозой исчезновения вид попугаев, родной для Новая Зеландия. Это необычное животное, поскольку это самая долгоживущая птица в мире (может жить до 90 лет). При весе около 3-4 кг это также самый тяжелый, единственный нелетающий и ночной попугай в мире. Мир.  

Какапо населяли Новую Зеландию с момента их эволюции в изоляция но их население быстро снизился. В 1970-х годах было известно только 18 мужчин какапо. Существование самок какапо было подтверждено в 1980 году. Благодаря интенсивной охране природы попугаи какапо были спасены от грани исчезновения. В 51 году их было 1995. Сегодня живы 247 какапо.^1,2.  

В целях содействия сохранению в 125 году был запущен проект Какапо2015+, направленный на секвенирование геномов 125 живых какапо, а также некоторых важных недавно умерших особей. Идея заключалась в том, чтобы улучшить генетический контроль какапо, особенно для решения проблемы низкой репродуктивной способности (бесплодия) и болезней, которые мешают выздоровлению. Полная сборка эталонного генома отдельного какапо на уровне хромосом была завершена в 2018 году.³.  

В исследовании, опубликованном 29.^th В августе 2023 года исследовательская группа сообщила о секвенировании геномов почти всей популяции какапо (по состоянию на 2018 год), а именно 169 какапо, взятых из 125 живых особей и 44 сохраненных образцов. Данные на уровне популяции связывают генетическое разнообразие видов с конкретными последовательностями ДНК, связанными с такими характеристиками, как восприимчивость к болезням, рост птенцов и т. д. Это может помочь раньше выявить риски для здоровья, чтобы спланировать лечение, адаптированное для конкретной птицы какапо. Этот подход к выявлению конкретных генетических особенностей, имеющих решающее значение для выживания, может быть перепрофилирован для управления сохранением других видов. находящихся под угрозой исчезновения вид^4,5.  

Ссылки:  

1. Департамент консервации. Правительство Новой Зеландии. Какапо Восстановление. Доступны на  https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/ 

2. Музей естественной истории. Причудливые какапо Новой Зеландии оказались на грани исчезновения. https://www.nhm.ac.uk/discover/new-zealands-quirky-kakapo-are-pulled-back-from-extinction.html 

3. Департамент консервации. Правительство Новой Зеландии. Секвенирование гена Какапо125+ https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/what-we-do/research-for-the-future/kakapo125-gene-sequencing/ 

4. Университет Отаго, 2023 г. Новости – Спасение видов от вымирания – высококачественное секвенирование популяций какапо обеспечивает прорыв в понимании ключевых природоохранных генетик. Доступны на https://www.otago.ac.nz/news/otago0247128.html По состоянию на 29 августа 2023 г.  

5. Гулин Дж., Ле Лек М.Ф., Уолд Дж. и др. Общевидовая геномика какапо предоставляет инструменты для ускорения выздоровления. Нат Эколь Эвол (2023). https://doi.org/10.1038/s41559-023-02165-y  Препринт на bioRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2022.10.22.513130