The assay time is considerably reduced from about an hour to few minutes by the newly reported RTF-EXPAR method which uses reverse transcriptase-free (RTF) approach for conversion of РНК в ДНК followed by EXPAR (Exponential Amplification Reaction) for amplification at single temperature.
Controlling the rate of Covid-19. spread requires an accurate and a faster virus testing strategy. ОТ-ПЦР (reverse transcriptase polymerase chain reaction), the most accurate testing method being currently employed is a two-step test that takes around 60 minutes per sample.
Исследователи из Университета Бирмингема сообщили о новом методе обнаружения SARS-CoV-2. Это может обеспечить гораздо более быстрое тестирование и достаточно чувствительно.
Обнаружение вирусной РНК ОТ-ПЦР (полимеразная цепная реакция с обратной транскриптазой) включает преобразование вирусной РНК в комплементарную ДНК (кДНК) с последующей амплификацией кДНК с помощью количественной ПЦР (кПЦР). Затем кДНК детектируют с помощью флуоресцентного красителя. На это уходит до часа.
The assay time is considerably reduced from about an hour to few minutes by the newly reported RTF-EXPAR method which uses reverse transcriptase-free (RTF) approach for conversion of RNA into ДНК followed by EXPAR (Exponential Amplification Reaction) for amplification at single temperature. The amplification taking place at a single temperature is the key to speed, because it avoids lengthy heating and cooling steps of RT-PCR. Further, the section of DNA being amplified is smaller compared RT-PCR. Hence, EXPAR generates up to 108 strands of DNA product in few minutes. The duplex formation is monitored, as in RT-PCR method using fluorescent dye, SYBR Green.
Интересно, что новый метод может быть модифицирован для обнаружения ряда других инфекционных заболеваний, вызываемых РНК-вирусами, например Эбола, RSV и т. Д.
Источник (ы):
Картер и др. (2020). Выявление РНК SARS-CoV-5 менее чем за 2 минут с использованием реакции экспоненциальной амплификации без обратной транскриптазы, RTF-EXPAR. Препринт. Опубликовано в medRxiv. Опубликовано 04 января 2021 г. DOI: https://doi.org/10.1101/2020.12.31.20248236
